Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC105243.1-202ENST00000583942 847 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RN7SL263P-201ENST00000467969 290 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms