Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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