Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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SMCO1Q147U7 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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SMCO1Q147U7 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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