Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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ITGA9Q13797 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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ITGA9Q13797 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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