Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms