Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
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TCOF1Q13428 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
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TCOF1Q13428 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
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TCOF1Q13428 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
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TCOF1Q13428 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
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TCOF1Q13428 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
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TCOF1Q13428 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
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TCOF1Q13428 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.4□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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TCOF1Q13428 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
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