Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
GRIK2Q13002 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms