Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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PTP4A2Q12974 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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PTP4A2Q12974 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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PTP4A2Q12974 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTP4A2Q12974 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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