Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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