Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms