Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms