Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms