Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP47Q96K76 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
USP47Q96K76 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP47Q96K76 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms