Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4b1Q7TS58 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms