Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atl2Q6PA06 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms