Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc18Q640L5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc18Q640L5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc18Q640L5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
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