Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms