Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms