Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa6P50704 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa6P50704 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.7 ms