Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbx2P48031 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms