Protein–RNA interactions for Protein: O35437

Tcf21, Transcription factor 21, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf21O35437 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tcf21O35437 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tcf21O35437 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tcf21O35437 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tcf21O35437 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf21O35437 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tcf21O35437 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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