Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf172C9J069 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms