Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SH3BP4Q9P0V3 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP4Q9P0V3 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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