Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms