Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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ZNF548Q8NEK5 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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ZNF548Q8NEK5 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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ZNF548Q8NEK5 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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ZNF548Q8NEK5 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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