Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CNGB1Q14028 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms