Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms