Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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CUL3Q13618 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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CUL3Q13618 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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CUL3Q13618 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CUL3Q13618 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CUL3Q13618 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CUL3Q13618 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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