Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL132671.1-201ENST00000415736 308 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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