Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms