Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms