Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 IGLV1-41-201ENST00000519790 406 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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