Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ACADSB-202ENST00000368869 1599 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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