Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 KCTD6-201ENST00000355076 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC115837.1-201ENST00000517662 1001 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC013470.2-202ENST00000635746 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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