Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms