Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.4 ms