Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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