Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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CCDC93Q567U6 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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CCDC93Q567U6 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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CCDC93Q567U6 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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CCDC93Q567U6 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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