Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LETM2Q2VYF4 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms