Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NDUFA9Q16795 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms