Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB39AQ14964 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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