Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms