Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms