Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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TRAF1Q13077 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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TRAF1Q13077 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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TRAF1Q13077 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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TRAF1Q13077 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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