Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.4 ms