Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms