Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO36-201ENST00000283946 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 C15orf41-214ENST00000569302 1325 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 2102 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 DGKG-203ENST00000382164 3152 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NR2F1-AS1-208ENST00000606233 2264 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 GZMA-201ENST00000274306 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 IGBP1-AS1-201ENST00000366397 542 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ENTPD3-AS1-201ENST00000420850 791 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00851-201ENST00000423033 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL365295.1-204ENST00000425648 553 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC006450.2-201ENST00000429482 581 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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TIMMDC1Q9NPL8 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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TIMMDC1Q9NPL8 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC091839.1-201ENST00000513087 269 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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TIMMDC1Q9NPL8 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 METTL18-202ENST00000310392 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4ENIF1-201ENST00000330125 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PIWIL4-201ENST00000299001 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP58-202ENST00000369704 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
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