Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms