Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms