Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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